有關腸道菌的研究以及應用，在近年來成為相當熱門，大家最知道的部份就是改善或調節自身免疫力，在最近新冠肺炎的影響下，許多專家將研究以益生菌可能帶來的正面效益為主。
於『英國醫學期刊（British Medical Journal）』所出版的『腸胃（Gut）』期刊研究發現，罹患新冠肺炎的確診者與非感染者的糞便中研究出菌相有顯著的差異，並已於全球各地引起關注。
香港中文大學醫學院一項最新研究發現，分別從100名新冠肺炎確診者及78名疫情尚未爆發前的健康者身上採取糞便。結果發現，確診者身上能促使身體啟動免疫反應對抗病毒的微生物比健康者少了許多，即使病人體內病毒已清除，但其腸道微生態失衡的狀態仍然持續30天，可能導致一系列長期病徵，這種狀況稱為「長新冠（Long COVID）」。
目前最讓各國專家感到棘手的是，當痊癒後所產生的後遺症，包括、焦慮疲憊、憂鬱、虛弱、注意力和記憶力變差…等，也可能是跟腸道的益菌不平衡有關，「菌相失衡導致嚴重的新冠肺炎症狀，若痊癒後仍持續失衡，則可能讓身體持續呈現發炎的現象，導致各種後遺症，」主要研究者為香港中文大學消化疾病研究所教授黃秀娟（Siew Ng）所說。
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香港中文大學發現新冠患者的腸道內缺乏可調節免疫力的益菌 八成新冠患者出現「長新冠」症狀 腸道微生態失衡成關鍵 (cuhk.edu.hk)